Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Apobec3Q99J72 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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