Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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