Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Def8-204ENSMUST00000108830 3191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Trcg1-201ENSMUST00000093837 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gpr83-201ENSMUST00000034408 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Dsg3-201ENSMUST00000070892 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Acbd5-202ENSMUST00000114523 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm43657-201ENSMUST00000200336 3833 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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