Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gpc6Q9R087 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms