Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd13P70217 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms