Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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