Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DmdP11531 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
DmdP11531 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
DmdP11531 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms