Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms