Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Cln3Q61124 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Cln3Q61124 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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