Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Irf5P56477 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Irf5P56477 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms