Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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