Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxb1P17919 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms