Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc166S4R181 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms