Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt6bQ9Z331 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt6bQ9Z331 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms