Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top3bQ9Z321 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms