Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crlf3Q9Z2L7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Crlf3Q9Z2L7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms