Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms