Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms