Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn6Q9Z262 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms