Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms