Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ror1Q9Z139 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ror1Q9Z139 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms