Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms