Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pacsin2Q9WVE8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacsin2Q9WVE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms