Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms