Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srd5a3Q9WUP4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms