Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms