Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms