Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms