Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slit2Q9R1B9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms