Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htra1Q9R118 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms