Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms