Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod1Q9R0E2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms