Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms