Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms