Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms