Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms