Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trpc3Q9QZC1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trpc3Q9QZC1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Trpc3Q9QZC1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Trpc3Q9QZC1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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