Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nphp1Q9QY53 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms