Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms