Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms