Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Jag1Q9QXX0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jag1Q9QXX0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms