Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms