Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcsk1nQ9QXV0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms