Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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