Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg2Q9QXK3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg2Q9QXK3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms