Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms