Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms