Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms