Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim44Q9QXA7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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