Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms